关于朱清时和他的“量子佛学”的评价如下：
1、朱清时校长是科大的第二任校长， 仅次于郭沫若校长。而他的这两个任期，正是中国高等教育大发展大变革的年代，这就注定了他不可能是一个平凡的科大校长，他要 么好得不平凡，要么糟得不平凡。 遗憾得是，在第一个任期，朱清时校长犯下了一系列战略性的 错误，这使得他有极大的风险走向糟得不平凡。
2、扩张年代的收缩，朱校长的两个任期，是中国高等教育大发展大变革的年代。自新院系调整以来，高等教育的格局还未曾这样深刻而激烈地变化过。 本科生的大规模扩招，学费的直线上涨，院校的大规模合并，接着 是研究生的扩招，即将到来的博士扩招，以及各院校拔地而起的楼群， 这一切勾勒出了中国高等教育的时代主题：扩张。